与欧美等国家相比，日本有机农业经营以小规模农场和农户占多数，有机农业主要以农作物栽培为主，有机畜牧业发展相对比较薄弱。在实行有机栽培的作物中，有机稻米占50%，有机蔬菜占35%，其余为有机水果、有机茶和有机奶肉蛋等。除有机农产品外，日本还有各类特别栽培的农产品，如无农药、减化肥栽培的农产品，减农药、无化肥栽培的农产品，减农药、减化肥栽培的农产品等等。其栽培面积是有机农产品栽培面积的3~4倍。日本有机农业比较注重精耕细作，强调有机农业的功能和提高农产品的自给率，提倡减农药、减化肥的生产方式。

日本有机农产品销售的最大特征是重视直销。上世纪七十年代赴阶段，日本有机农产品流通主要采取生产者和消费者直接结合的办法，即成立产销联合组织，其主要优势在于使有机农产品的生产者与消费者之间建立“面对面的相互信赖”关系。1985年随着有机农产品生产规模的不断扩大，一些地方出现了专业配送有机农产品的流通组织，也有一些地方依托生协实行专业配送，这样流通配送覆盖面不断扩大，消费者可以随时随地买到有机农产品。1996年以来，日本市民对有机农产品的需求量不断增加，国外有机农产品也大量进入日本各地，因而日本有机农产品流通进入了多元化流通时期。其流通的主要形式有六类：

①直销：以产销联合体为主要销售形式；

②宅配：以专业流通配送到户为主要销售形式；

③配送：以生协为运作主体，以配送为主要销售形式；

④专柜：大卖场、超市与有机农场进行订单销售；

⑤专卖店：以连锁专卖店的形式进行销售；

⑥食品加工厂：食品加工厂与有机农场进行订单销售。

从总体上看，在日本有机农产品流通与消费方面有以下四个特征：

①注重食品的安全性：消费者对有机农产品的需求量逐年上升，据预测，日本的有机食品市场每年以20~30%的速度增长。受疯牛病、口蹄疫、O157大肠杆菌等影响，日本市民对食用农产品的安全、卫生、新鲜等提出了更高的要求，有80%的市民都把食品安全作这第一选择。

②鼓励宅配销售方式：日本政府和各类协会都鼓励有机农产品宅配销售，专业配送组织或生协与有机农产品者或组织签订农产品收购合同，由配送组织或生协定期收购并在配送中心加工、分装，然后将分装成箱的有机农产品直接送到消费者家中，或送到分送点，再由分送点分发给周围的消费者。产品销售后的利润，70%给生产者，20%给配送组织或生协，10%给分送点。配送组织或生协在销售上多采用会员制的办法，并根据各会员每年的消费数量，将一小部分利返回经消费者。

③推行订单销售：大卖场或超市与有机农产品生产基地鉴订销售合同，有机农产品销售实行专柜化。如JUSCO商社在日本设立了200多专柜销售有机蔬菜，1996年销售额为30亿日元，1999年达60亿日元，2000年超过300亿日元。伊藤忠商社与山梨县大泉村300多家农户实行订单有机农业，2000年有机蔬菜销售额达100亿日元。

④加强产销沟通交流：为了促进有机农品的流通与销售，日本十分注重加强生产者与消费者之间的相互沟通，通过多种形式在两间之间架起理解的桥梁。各地的有机农业协会都会定期或不定期地举办有机农业节、有机农业体验教育、印刷分发宣传资料、举办有机食品品尝会、演讲会、开展有机农业相关调查等，从多个侧面加强生产者与消费者之间的交流，从而调动了不少消费者主动参与有机农业活动，并为发展有机农业献计献策。